ליבוביץ׳ היה אחד ההוגים המקוריים בעולם היהודי במאה ה-20, ובמדינת ישראל. הוא ראה את האמונה באלוהים כעניין פרטי לחלוטין, והפריד באופן ברור את האמונה הטהורה, מכל משמעות מקובלת של תגמול, שכר וברכה. כפי שהוא הגדיר זאת: ״אלוהים איננו ביטוח לאומי או קופת חולים״. הוא גם יצא נגד החיבור בין הדת והמדינה, נגד כל קדושה שאיננה אלוהים, והייתה לו ביקורת חריפה על הממסד הדתי בארץ. ליבוביץ׳ נלחם על דמותה של היהדות בימינו, אך דומה שהוא נותר בעמדת מיעוט בנושא זה.